Rekonstrukce muzea byla podle Lukeše jednou z největších a nejsložitějších takových oprav v historii ČR. Budova, jež je národní kulturní památkou, před ní byla v havarijním stavu a opravovat se muselo vše. Muzeum dostalo i nové technologie a výstavní prostory se díky ní rozšíří o 30 procent.
Částečný provoz muzea zahájí Česko-slovenská / Slovensko-česká výstava, která je připravena ke stému výročí vzniku Československa a mapuje všechny klíčové okamžiky bouřlivého 20. století v Československu, ale i konkrétní osudy obyčejných lidí.
Originální dokumenty pohromadě
Poprvé v ČR na ní bude pohromadě soubor originálních dokumentů, které osudově ovlivnily československé dějiny - Pittsburská dohoda, mnichovská dohoda, vídeňská arbitráž nebo československé ratifikace mírových smluv z Versailles, Saint Germain a Trianonu, jež ukončily první světovou válku. Výstava měla premiéru na Slovensku, kde ji vidělo 76 tisíc návštěvníků.
Výstava 2 x 100 představí 200 nejvzácnějších a nejzajímavějších exponátů ze sbírek muzea a připomíná 200. výročí založení této sbírkové instituce. Podle ředitele jde o výstavu trezorovou, takto unikátní soubor ještě nikdy podle něj nebyl v Česku vystaven. Budou tomu odpovídat i přísná bezpečnostní opatření.
Generální oprava Národního muzea začala v roce 2015, stará budova ale byla kvůli přípravám zavřená už několik let předtím. Původní plán byl otevřít celé muzeum právě ke stoletému výročí vzniku Československa. V první polovině prací ale postup zbrzdily některé nečekané skutečnosti, třeba rozsáhlejší poškození maleb v Pantheonu, archeologický nález, nesrovnalosti v projektové dokumentaci nebo změny požadované památkáři, uvedl již dříve ředitel.