Městská část Praha 9 zahrnuje katastrální území Prosek, téměř celé Hrdlořezy, dále pak většinu katastrálních území Vysočany a Střížkov, menší části katastrálních území Hloubětín a Libně a nepatrnou část katastrálního území Malešice.
Na většině území bývala pole. Prosek byl jen malou vesničkou kolem románského kostela, několik ulic, vilek a domků kolem dnešní Martinovské ulice a jinak holá pláň téměř bez stromů. Na Palmovce stávaly budovy dolního Libeňského nádraží a za ním Židovský hřbitov, druhý nejstarší v Praze. Ten zmizel pod pětimetrovou navážkou. Mezi loukami a mokřinami se klikatila Rokyta. Nad se tyčil skalnatý pískovcový hřbet mířící od proseckého kostela sv. Václava k Bulovce. V oblasti mezi Hloubětínem a Vysočany se rozkládaly pohřebiště- ulice Drahobejlova byla keltské pohřebiště, okolí Rubešky sídlištěm knovízské kultury, vysočanská nemocnice germánským pohřebištěm. Od Podvinného mlýna podél Rokytky až na Palmovku existoval v pravěku jeden rozsáhlý sídlištní areál. Byli zde nalezeny kamenné nást